Il Comitato per il controllo analogo congiunto esercita funzioni di indirizzo e controllo strategico.
In particolare fornisce al Consiglio di Amministrazione indirizzi vincolanti sulle modalità di gestione economica e finanziaria dell’Azienda, esamina i programmi annuali e pluriennali, il budget ed il bilancio d'esercizio ai fini della loro sottoposizione all'approvazione da parte dell'Assemblea. Inoltre, esamina periodicamente le relazioni sullo svolgimento dei servizi proposte dal CdA.
A seguito dell'elezione di 5 nuovi componenti avvenuta il 14/07/2026, Il Comitato risulta così composto:
- Area Nord: Stefano Crippa (Comune di Bernareggio), Sara Dossola (Comune di Lesmo), Marianna Cannone (Comune di Burago di Molgora)
- Area Centro: Diego Cataldo (Comune di Trezzano Rosa), Marta Gerli (Comune di Pioltello), Paola Micci (Comune di Liscate)
- Area Sud: Gianluca Di Cesare (Comune di Cerro al Lambro), Gabriele Guida (Comune di Paullo), Maria Teresa Marchetti (Comune di Colturano)